微生物污染是指微生物在膜-水界面上積聚，從而影響系統(tǒng)性能的現(xiàn)象。由于地表水和淺層地下水中都存在微生物，因此膜組件內(nèi)部的潮濕和黑暗環(huán)境可以為微生物的生長提供理想的環(huán)境。如果它們在進入反滲透系統(tǒng)之前沒有被殺死，這些微生物將利用反滲透膜作為載體來幫助反滲透濃縮水部分中的營養(yǎng)鹽繁殖和生長。在水溫較高的條件下，生長較快。幾天之內(nèi)，反滲透膜表面會形成生物膜層，這會導(dǎo)致反滲透系統(tǒng)的入口和出口之間的壓力差迅速變大，而產(chǎn)水量和脫鹽率卻迅速下降。污染產(chǎn)品水。發(fā)生微生物污染時，通常會伴有有機污染。反滲透供水中的微生物包括細菌，藻類，真菌及其芽，孢子和病毒。細菌顆粒非常小，通常大小為1-3 μm，而病毒甚至更小，顆粒大小為0.01-0.2 pm。藻類和真菌比細菌大得多。細菌的含量通常很大。當含量高時，一滴水可能含有數(shù)千萬種細菌。當含量低時，1 mL的水中還含有幾種細菌。地表水中含有更多的微生物。近年來，在地下水中經(jīng)常發(fā)現(xiàn)細菌繁殖的例子。

微生物可被視為帶負電荷的膠體，大多數(shù)微生物可通過冷凝和過濾除去。但是很難完全刪除它。盡管使用了氯化，消毒，氧化等手段，仍然會有一些，甚至以孢子的形式暫時隱藏。有實例證明，即使采用細密過濾和超濾，有時也不能令人滿意。反滲透供水系統(tǒng)中的微生物泥（生物膜）是由營養(yǎng)環(huán)境中的膜表面上的微生物與有機和無機物質(zhì)代謝而形成的。特別是當水通量過高或發(fā)生濃度極化時，微生物以幾倍的生長速度迅速繁殖。

微生物膜是一種粘性物質(zhì)，具有很強的附著力，難以去除。它可以防止微生物由于水的剪切作用而被沖走，并且不易受到化學(xué)消毒劑的影響。由于不易完全清除，因此會加速粘液的再生。這些微生物是附著的細菌。在幾種反滲透膜污染類型（微生物污染，化學(xué)污染，顆粒污染和膠體污染）中，微生物污染具有其特殊性，并且是反滲透水處理操作困難的重要原因。目前，在中國的反滲透水處理系統(tǒng)的運行中，膜的微生物污染問題變得越來越突出。

反滲透膜上的微生物污染是獨特的，其特征如下：

（l）合格的給水SDI不能保證避免微生物污染。當給水SDI <4，甚至SDI <3時，膜表面仍可能出現(xiàn)大量粘液狀生物膜，這取決于細菌在水中的繁殖狀態(tài)和水通量的大小。

（2）微生物污染發(fā)展迅速。一旦細菌群落出現(xiàn)在膜上，特別是在濃度極化的情況下，在一兩個月甚至幾天內(nèi)就會形成粘膜，并且會出現(xiàn)過多的供水壓降，以保持反向滲透為了生產(chǎn)水，需要增加給水泵的壓力，從而增加能耗。

（3）雖然生物膜（生物泥）引起膜結(jié)垢，但它也增加了膜的透水性，降低了產(chǎn)水量，并可能降低了產(chǎn)品的水質(zhì)。膜結(jié)垢加劇了濾網(wǎng)的結(jié)垢，導(dǎo)致給水壓降上升。

（4）生物膜（污泥）不溶于酸，幾乎不溶于堿，并且?guī)缀醪皇芩鞯募羟辛Φ挠绊憽＜词菇?jīng)常清洗，也無法清洗掉。也很難通過消毒將其完全去除。

家用和商用凈水設(shè)備不能使用化學(xué)消毒來殺死微生物。超濾膜可用作預(yù)處理，可以有效攔截微生物并保護反滲透膜。紫外線紫外線燈也非常有效。一種有效的殺滅微生物的方法，其殺滅率可以達到90％以上。